当最后一个敌人倒下时，竞技场的地面裂开，苏夏掉入更深的空间。这里漂浮着无数记忆碎片，每一片都代表着一个文明的覆灭。守护者的声音再次响起：“看看吧，这就是过度发展科技的下场。你们凭什么认为自己不会重蹈覆辙？”
苏夏伸手触碰一片记忆碎片，瞬间感受到了那个文明毁灭时的绝望与痛苦。但紧接着，他调出系统界面，展示那些通过系统帮助而获救的人、那些为了守护世界而牺牲的英雄：“因为我们懂得反思，懂得珍惜。科技不是毁灭的工具，关键在于使用它的人。”
守护者陷入了长久的沉默。水晶柱的光芒渐渐减弱，“火种”缓缓飞出，悬浮在苏夏面前。系统适时弹出提示：【完成隐藏任务“文明的抉择”！奖励：时空回溯能力（可短暂逆转时间）、双系统融合核心】
就在苏夏准备接过“火种”时，空间突然剧烈震动。神秘组织的残余力量突破防线，杀了进来。为首的是一个带着机械义眼的男人，他手中的武器散发着诡异的紫色光芒，正是之前在北极基地出现过的系统持有者的同类装置。
“把‘火种’交出来！”机械义眼男怒吼道，身后的手下纷纷举起武器，“你们以为能阻止我们？太天真了！”
苏夏将“火种”小心翼翼地收入系统空间，双系统的能量在他周身流转，形成一道坚不可摧的防护屏障：“想要，就来拿！”
一场新的激战在时空裂隙中展开。机械义眼男的攻击带着腐蚀时空的力量，所到之处，空间出现一道道裂痕。苏夏灵活运用时空回溯能力，在关键时刻逆转时间，躲避致命攻击。严荣相等人也突破重重阻碍，加入战斗，与苏夏并肩作战。
战斗中，苏夏发现机械义眼男的攻击模式与之前的面具人有着微妙的联系。他猜测这些人都是神秘组织“双生系统计划”的产物，只不过被植入了不同的邪恶程序。
“是时候结束这一切了！”苏夏大喝一声，双系统彻底融合。他的身体周围环绕着黑白双色的能量巨龙，所过之处，敌人的攻击被尽数粉碎。机械义眼男在这般强大的力量面前，终于露出了恐惧的神色。
最终，苏夏发动致命一击，能量巨龙直接贯穿了机械义眼男的身体。神秘组织的残余力量在失去首领后，很快被剿灭。
当苏夏带着“火种”走出神殿时，沙漠的天空已经破晓。他知道，这只是漫长战斗的一个阶段，神秘组织的阴谋远未结束