批不仅技术精湛、而且悍不畏死、忠于天皇的“空中武士”。他还非常重视飞行员梯队的建设，希望能建立起一个能够源源不断地为海军航空兵输送合格人才的培养体系。
正是由于山本五十六等一批富有远见的航空派将领的不懈努力，日本海军航空兵在1930年代得到了飞速发展，无论是在飞机性能、飞行员素质还是战术运用方面，都达到了当时世界领先水平，甚至在某些方面（比如舰载鱼雷攻击技术）还超过了英美等老牌海军强国。这支精锐的“空中力量”，也成为了山本五十六日后敢于策划和实施珍珠港偷袭计划的最大底气所在。
在山本五十六等航空派将领的推动下，日本海军航空兵的“硬件”是上去了，但“软件”——也就是作战思想和战术运用——也必须跟着更新换代才行。
在传统的观念里，航空母舰虽然也能搭载飞机，但它更多的是被看作是舰队的“眼睛”（负责侦察）或者是战列舰的“小弟”（负责提供一些有限的空中支援），很少有人会把它当成海战的“主角”来看待。海战的胜负，最终还是要靠战列舰那排山倒海的巨炮来决定。
但山本五十六不这么认为！他觉得，既然飞机才是未来海战的“杀手”，那么航空母舰作为搭载和运用飞机的平台，其地位和作用就必须得到根本性的提升！
山本五十六是第一个（或者说是最重要的一个）在日本海军中明确提出并大力倡导“航空母舰集群作战”思想的将领。他认为，单艘或少数几艘航空母舰分散使用，力量太薄弱，很容易被敌人各个击破。要想发挥出航空母舰的最大威力，就必须将多艘航空母舰集中起来，组成一个强大的、统一指挥的“航空母舰打击集群”（也就是后来我们常说的“航母战斗群”的雏形），利用其搭载的大量舰载机，对敌方舰队或重要目标，实施饱和式的、毁灭性的集中打击！
这种“把鸡蛋放在一个篮子里”（当然，这个篮子必须足够坚固，而且能先发制人）的作战思想，在当时看来是相当激进和冒险的，与当时世界上其他国家海军（包括美国海军在内）那种更倾向于将航空母舰分散配置到各个舰队中、主要承担辅助任务的传统做法，形成了鲜明的对比。
为了将这种“航母集群打击”的思想付诸实践，山