凯旋而归的联盟舰队，在民众的欢呼与敬仰中缓缓驶入总部港湾。战舰上的战士们，虽面带疲惫，却难掩眼中胜利的光芒。艾琳深知，短暂的休息过后，是更为艰巨的挑战等待着他们，必须抓住这来之不易的喘息时机，全面提升联盟实力。
在科研领域，对“混沌之心”的探索成为重中之重。科学家们将之前缴获的黑暗魔法器物与“混沌之心”能量研究相结合，试图寻找一种全新的能量转化模式。艾达凭借自身卓越的科技天赋，协助研发团队设计出了一套名为“灵能聚能矩阵”的装置。这一装置能够精准捕捉“混沌之心”逸散的能量，并将其转化为稳定且可控的灵能，为战舰的动力系统、护盾发生器以及各种武器装备提供强大助力。经过反复测试，装配了“灵能聚能矩阵”的实验战舰，其航行速度提升了 30，护盾强度在原有基础上翻倍，武器充能时间缩短一半，实战性能得到飞跃式发展。
不仅如此，科学家们还从邪教组织残留的神秘文献中挖掘到一些古老的生物技术资料。这些资料记载着一种能够强化生物机体的基因改造方法，虽存在一定风险，但一旦成功，将大幅提升战士们的身体素质与战斗潜能。联盟谨慎挑选了一批自愿参与实验的精英战士，在严密监控下展开基因改造研究。初期，实验遭遇重重困难，部分战士出现身体排异反应，甚至陷入昏迷。但科研团队毫不气馁，日夜钻研调整方案，终于成功攻克难关。改造后的战士，肌肉力量增强 50，反应速度提升 40，骨骼密度加大，能够承受更强冲击力，成为战场上令敌人胆寒的超级战士。
军事建设同样紧锣密鼓。基于“破晓行动”的实战反馈，军事指挥官们重新规划了“堡垒星系”的布局。他们引入了“多层次防御体系”概念，在每个“堡垒星系”周边设置三道防线：最外层是由无人战机、电磁干扰卫星构成的预警拦截网，能够提前发现并干扰来袭敌机；中间层布置海量的浮游炮阵列与能量护盾发生器，形成密集火力打击区与防护屏障；核心层则驻扎着最精锐的王牌部队，配备重型攻坚武器，作为最后的决战力量。三道防线相互配合，层层递进，极大增强了“堡垒星系”的防御韧性。
为进一步提升“快速反应舰队”的机动性，工程师们研发出了“量子跃迁推进器