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伴随着新版本主线任务的正式接取，《妖精之旅》3.1版本“钢铁意志”的故事正式拉开了序幕。
由于在3.0版本的结尾部分，绯樱为了保护同伴们，独自硬扛了量子裁决战舰的全力攻击，身体承受了巨大的负荷和创伤。
如今，她的身体需要一段时间来进行恢复和调整。
因此，3.1版本开头的部分主要内容，就是玩家需要操控身体虚弱的绯樱，前往机械之都高塔上层的医疗设施，利用那里的先进仪器来检查身体状况。
这些都是一些相对简单的小任务，难度不高，主要作用是让玩家熟悉新版本的节奏。
其中也不乏一些高塔上，一些新出场的人偶NPC角色，丰富着游戏的细节内容。
而剩下的大部分，都是绯樱、茉莉、蕾和人偶甜甜的温馨日常。
可温馨的小日常并没有持续太久。
主线剧情就伴随着死之妖精的登场，出现了第一阶段的转折。