谣传中教堂贩卖婴儿，用人体做药等传言进行调查，最后得出这些都是子虚乌有，洋教本是劝人向善等结论。
曾国藩的调查算是不偏不倚，但此时的清廷风气，反洋教非常激烈，于是他遭到了全天下士大夫的痛骂。其实谁处理这件事谁都落不着好，所以没人愿意去处理，清廷将曾国藩特意从两江调到直隶当总督去做这件事，不排除有打击他名望的目的。
曾国藩引咎请辞，李鸿章接手此案。耍了各种手段，他倒是不拖延，知道官场上那套洋人不认，洋人要惩办凶手，清廷根本抓不到，李鸿章就按照教堂受害洋人数量，在天津找了一批死囚定罪，请来洋人当众砍头。清廷最后赔了五十多万两银子，并派崇厚去法国道歉，结果崇厚到了法国，却找不到道歉的人，因为法国皇帝都被抓了。在法国港口逗留了好几个月，才联系上法国官方进行道歉，也算是个趣闻。
曾国藩请辞后不久，清廷任命的两江总督马欣怡被刺杀，正是鼎鼎大名的刺马案。派了好几拨大臣去审嫌犯张文祥都得不出结论，甚至有大臣因为压力太大，直接请辞，撂挑子不干了。这件事很难办，马欣怡上任两江总督肩负了一项使命，清查南京陷落后太平军藏宝的下落，曾国藩攻陷南京后，声称粤匪圣库中空无一物，但没人信，所以让人不由怀疑刺杀马欣怡是曾国藩的手段，大家平时骂一骂曾国藩的胆子有，真卷入曾国藩跟朝廷在两江的权力争斗，却没敢有这个勇气。
清廷见派下去调查的大员一个个遮遮掩掩，干脆再让曾国藩回两江处理此事。这件事确实十分诡异，马欣怡是慈禧的人，此人没有派系，是慈禧钦点的。他要去的地方是两江，默认是湘军的势力范围，因为湘军裁军后，立功的将领并没有撤，一个个都留任两江，不是在江苏就是在浙江做官，上上下下的要害部门全是湘军旧部。等于慈禧安插了一个自己人，跑曾国藩的地盘做官，然后被刺杀了。
刺杀的过程也很离奇，张文祥是孤身一人杀的马欣怡，杀完人还不怕，束手就擒，直言人是他杀的，敢作敢当。马欣怡也奇怪，他上任之后，说部下孱弱，请奏从各营抽调2500人，他亲自训练这些人，但他被刺杀的时候，没有一个人站出来保护他，他被刺的地点都很奇怪，不是在没人的地方，比如在床上，而是在